Lorsqu'il était encore enfant, Karoku servait de cobaye à Kafka, avant que ses parents ne trahissent l'organisation en prenant la fuite avec leur fils. Après des années en cavale, les trois fugitifs ont réussi à trouver refuge dans la forêt irisée, où la flore particulière crée des mirages qui transforment l'endroit en un vrai labyrinthe...

La famille prend petit à petit ses marques dans ce nouvel environnement, lorsque le jeune homme tombe par hasard sur une créature étrange avec qui il finit par se lier d'amitié et qu'il décide d'appeler "Nai' ! Mais avec Kafka qui a des yeux partout, cette vie paisible va-t-elle pouvoir durer ?