Diablo, Colossus et Kitty Pryde sont de retour parmi les X-Men mais peut-on vraiment rentrer chez soi après être partis si longtemps ? Une étrange nouvelle équipe apparaît, qui soulève beaucoup de questions et envoie les mutants en quête de leur mentor disparu... Où peut bien être passé le Professeur Xavier ? Entre la fin 1998 et le début 1999, les deux principales séries mutantes proposaient deux crossovers, Children of the Atom et The Hunt for Professor X, signés par Joe Kelly (Deadpool) et Steven T. Seagle (Alpha Flight), sur des dessins de Chris Bachalo (Generation X) et Adam Kubert (Wolverine), entre autres. Ce volume signe la fin de la collaboration des deux auteurs sur les séries mutantes, un passage court mais apprécié des fans.